由反轉錄病毒所引起的RNA腫瘤病毒歸入腫瘤病毒(Oncovirinase)亞科，如人類T-淋巴性病毒1，2，5(HTLV-1，HTLV-2，及HTLV -5)。，其中HTLV-1為人類T細胞淋巴性反轉錄病毒(Human T cell lymphotropic retroviruse)被發現引起成人某些表皮T細胞淋巴瘤，HTLV-2，及HTLV -5則尚未確定與人類的那一特定疾病有關。
副反轉錄病毒除了腫瘤病毒亞科外，還有慢性病毒亞科(Lentivirinase)；人類免疫缺乏病毒1及2(HIV-1、HIV-2)可引起人類後天性免疫缺乏癥候群(aquired immune deficiency syndrome，AIDS)，AIDS是一種嚴重的免疫調解性障礙疾病，宿主易受伺機性感染(opportunistic infection)或腫瘤侵襲，臨床發現AIDS病毒的潛伏期很長，自六個月到兩年以上，其特征是除了宿主免疫系統受到嚴重抑制，同時有不尋常的腫瘤發生(如卡波西氏瘤)，廣氾有伺機性感染，在流行病學上的研就認為同性戀者、雙性戀者及性關系復雜者為高危險群，或由傳染性的血液或血液產品也是此類病的感染方式，血友病患者因常接受輸血而增加了病毒感染的機率；及泡沫病毒亞科(Spumavirinae)，其引起感染細胞產生泡沫型退化性疾病，但未發現與人類疾病有關。
反轉錄病毒的DNA插入宿主細胞染色體時，在5’LTR的U3左端和3’端LTR的U5右端各丟失2 bp，而在宿主染色體插入位點上生成4～6 bp的重復序列。反轉錄病毒的DNA基因組整合在宿主染色體上的位點是隨機的。每個受感染的細胞一般有1～10份前病毒拷貝。反轉錄病毒DNA的整合是復制病毒RNA的必經階段。只有當受感染細胞處于細胞分裂期間，反轉錄病毒DNA基因組才能接觸到宿主細胞的遺傳物質。因此，反轉錄病毒只能在分裂中的細胞內復制。
LTR對病毒DNA整合進宿主細胞基因組和控制病毒RNA合成均有重要作用。