SEC 是利用多肽分子大小、形狀差異來分離純化多肽物質，特別對一些較大的聚集態的分子更為方便，如人重組生長激素（hgH）的分離，不同結構、構型的GH 在SEC 柱上分離行為完全不同，從而可分離不同構型或在氨基酸序列上有微小差異的變異體，利用SEC 研究修飾化的PEG 的分離方法，此PEC 具有半衰期長、作用強的特點。一些分子量較大的肽或蛋白均可利用此法分離分析。
