AILD的病因尚未完全闡明，病毒感染和藥物過敏等被認為是可能的原因。
1.藥物過敏 約有1/3的病例有藥物接觸史，常見的藥物有青霉素類、抗驚厥藥、口眼降糖藥、解熱鎮痛藥、磺胺類、氨基糖苷類、抗癲癇藥和疫苗接種等，提示抗原刺激有觸發作用。
2.病毒感染 有些患者體內EBV抗體滴度增加，有報道在AILD及相關疾病中EBV-DNA檢出率高達84%～97%。另有報道在14例病人的淋巴結內有風疹病毒抗原，提示本病與病毒感染有關。
3.膠原性疾病 本病有良性淋巴結增生和自身抗體產生，具有某些非特異性自身免疫病所共有的特點，因此膠原性疾病可能與本病發病有關，最主要見于系統性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕關節炎及舍格倫綜合征(干燥綜合征)等。