1．葡萄糖酸氯己定溶液偶可引起接觸性皮炎。高濃度溶液對眼結膜刺激性強。
2．葡萄糖酸氯己定溶液可使口腔表面著色，早者在使用后1周左右發生。使用6個月后約50%的患者可將牙齒染色，約10%的患者重度著色，較多牙斑塊沉積者著色更顯著。假牙因表面或邊緣粗糙可發生永久性著色。
3．葡萄糖酸氯己定溶液可發生味覺改變，繼續治療可恢復。
4．10～18歲小兒和青少年可發生口腔無痛性淺表脫屑。
5．葡萄糖酸氯己定溶液少見局部刺激和過敏反應。
6．小兒誤飲葡萄糖酸氯己定溶液后，可出現酒精中毒癥狀(如口齒不清、嗜睡、步態搖晃等)，應立即送急診處理。