分析誤差
薄層分析的誤差包括三個方面：點樣誤差、展開誤差、定位誤差和檢測誤差。
采用自動點樣器，誤差可控制在0.5%，熟練的分析人員用毛細管點樣，誤差小于1.0%，若用微量進樣器，誤差會大一些。
展開誤差來自鋪板的均勻性和樣品展開效果，若采用預制的高效薄層板，誤差會明顯降低，采用雙波長鋸齒掃描，也能有效降低展開誤差。
定位誤差值斑點的位置和大小判定，擴散、脫尾等易產生定位誤差。檢測誤差來自光源的穩定性、光檢測器的穩定性以及樣品對光吸收（或熒光產生）的線性度等方面。為減少這些誤差，需要非常精密的機電系統，這也直接導致產品高昂的價格。
通常情況下，薄層掃描分析的誤差在3%以下