自身免疫（30%）：
已證明本病與自身免疫關系密切，妊娠早期(前3個月)TPOAb陽性者，產后甲狀腺炎發病率高達30%～50%，產后TPOAb水平高者往往提示其產后免疫反彈現象及免疫介導的甲狀腺破壞程度嚴重，近些年也有人注意到妊娠早期自然或擇期流產(包括異位妊娠)后1年內可發生甲狀腺炎，類似于產后甲狀腺炎，且在妊娠前抗體陽性者較抗體陰性者發生流產危險性高2倍，非足月妊娠的體內免疫學變化足以使患者發生產后甲狀腺炎。
遺傳（20%）：
研究表明，本病具有HLA抗原多態性。大量的臨床及實驗室研究也提示Hashimoto甲狀腺炎與本病可能存在共同病因。
HLA抗原與產后甲狀腺炎發病相關性的解釋可能為：
(1)該病位點與HLA位點連鎖不平衡，也可能HLA在疾病過程中起直接作用。
(2)HLA的多態性可能是對抗原呈遞細胞呈遞特殊系列抗原肽能力的一種影響因素，因而可調節疾病的易感性。
飲食因素（15%）：
過量碘可誘發產后甲狀腺炎，甲狀腺功能減退最容易發生在日攝碘量高于其日需要量的有本病病史的婦女。