PCR或RT-PCR試劑盒的組成
核酸提取試劑
核酸擴增或逆轉錄-核酸擴增試劑
產物檢測試劑(有些使用全自動分析儀的PCR方法因其核酸擴增和檢測同時完成,故無專門的產物檢測試劑)
影響PCR試劑盒質量的因素
內在因素: 原材料、核酸提取方法、方法學設計
影響PCR試劑盒質量的因素: 擴增所需的原材料
寡核苷酸引物和探針
緩沖液和dNTP
聚合酶、逆轉錄酶等
PCR反應混合物
寡核苷酸引物和探針
其對試劑盒質量的影響首先是純度。純度的判斷可根據260/280吸光度比值來判斷,如?2.0,則需重新純化。另一種方法是將其在聚丙烯酰胺凝膠上電泳,如出現一條以上的帶或遷移位置錯誤,則需重新純化。
是否有污染。
結合特異性(濃度)
dNTP和緩沖液
dNTP(包括dATP 、dCTP、 dGTP和 dTTP或 dUTP)的濃度
緩沖液:在儲存和擴增循環中穩定、作為聚合酶活性所必須的Mg++(或用于rTth的Mn++)的濃度以及pH等
逆轉錄酶、DNA聚合酶
酶的濃度
酶的活性
核酸擴增方法
PCR
RT-PCR
轉錄依賴的擴增(TMA)
連接酶鏈反應(LCR)
鏈替代擴增(SDA)等
影響PCR試劑盒質量的因素: 核酸提取
核酸提取的有效性
核酸提取的簡便性
影響PCR試劑盒質量的因素: 產物檢測
雜交固相
特異探針及其標記物
影響PCR試劑盒質量的因素
內在因素: 原材料、核酸提取方法、方法學設計
外在因素:試劑盒的運輸和貯存外在因素:試劑盒的運輸和貯存
試劑盒的運輸和貯存
PCR試劑盒的有效期一般為6個月,這是指在適當的貯存溫度下。核酸擴增部分的試劑一般要貯存于-20℃下;產物檢測部分試劑則貯存于2~8℃。
試劑盒從廠家到用戶手中,均要經歷運輸及運輸中的貯存,任一環節的不當,均會影響試劑盒的臨床使用質量。
PCR試劑盒的分類
定性測定:PCR-ELISA、PCR-膜上雜交(雜交梳)、熒光PCR(分子信標和Taq Man等)
定量測定: PCR-ELISA 、Taq Man和Amplisensor熒光定量、 Amplicor PCR-ELISA定量等。
PCR試劑盒的選用原則
參考試劑生產廠家的信息廣告
參考同行對有關試劑盒的使用效果
參考有關機構的綜合評價
根據使用目的
根據所在實驗室的技術特點
根據所在醫院患者的承受能力
PCR試劑盒的質檢
外包裝:廠家名稱、檢測目的、批準文號、批號和有效期等。
內包裝:試劑瓶是否漏液、真空包裝是否破損以、試劑是否齊全以及是否有使用說明書等。
PCR試劑盒的質檢
采用血清(樣本)盤(Panel)質檢: PCR試劑血清(樣本)盤由一定數量的原血清陰、陽性樣本、2~3份純化核酸(DNA或RNA或cDNA)樣本以及3~5份系列稀釋陽性樣本所組成。樣本總數可定在20份左右。
原血清樣本用于判斷試劑盒對特定病原體核酸檢出的特異性、靈敏度和符合率;純化核酸樣本用于判斷DNA擴增或逆轉錄及DNA擴增的有效性;系列稀釋陽性樣本用于判斷試劑的測定下限。
試劑特異性、靈敏度和符合率計 算 公 式
試劑特異性、靈敏度和符合率計 算 公 式
靈敏度(%)= (a / a+c)′100%
特異性(%)= (d/b+d) ′100%
符合率(%)= (a+d/a+b+c+d) ′100%