來自中國農業科學院、荷蘭瓦赫寧根大學和研究中心、南京農業大學等機構的研究人員證實,在蕪菁(Brassica rapa)和甘藍(Brassica oleracea)中亞基因組平行選擇與形態多樣化和作物馴化有關聯。這一研究發現發布在8月15日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
中國農業科學院的王曉武(Xiaowu Wang)研究員、武劍(Jian Wu)副研究員及荷蘭瓦格寧根大學Guusje Bonnema博士是這篇論文的共同通訊作者。王曉武研究員現主要從事蕓薹屬和瓜類作物基因組學、蕓薹屬作物代謝組學研究、雄性不育功能基因組學、基于高 通量測序的分子標記開發與分子育種等研究。武劍副研究員則主要從事十字花科植物礦質營養含量的基因克隆和遺傳分析,蕓薹屬作物基因組學研究,蕓薹屬作物代謝組學研究,基于高通量測序的分子標記開發與分子育種等研究。
2014年,中國農科院蔬菜花卉研究所王曉武團隊和美國科學院院士邁克?菲林領導的團隊合作,對植物基因組多倍化進化過程中基因分化和多基因組分化機理進行了研究。相關成果日前在線發表于PNAS雜志上。
蕓苔屬(Brassica species)是十字花科中重要的一個屬,包含卷心菜、蕪菁和油菜等許多具有較高營養價值和經濟價值的作物,顯示出極大的表型變異。進化上,除了十字花 科共同經歷的γ、β和α古老的基因組多倍化事件外, 蕓苔屬植物基因組均經歷了全基因組三倍化復制(whole-genome triplication ,WGT)事件,但目前對于其對表型多樣化造成的影響仍不是很清楚。
在這篇文章中,研究人員對代表了不同形態的199個蕪菁及119個甘藍品種進行了重測序,鑒別出了古六倍化亞基因組水平上的一些選擇信號。針對顯示 典型葉球(leaf-heading)性狀的卷心菜形態,他們在蕪菁內鑒別出了亞基因組間顯示平行選擇跡象的4個亞基因組位點,在甘藍中鑒別出了4個這樣 的位點。14個亞基因組位點經過了選擇,并被這兩個物種所共享。他們還發現了強力的亞基因組平行選擇與塊莖形態類型:蕪菁和甘藍的馴化有關聯。
這些結果證實,兩種蕓苔屬植物基因組的古六倍化通過趨同亞基因組平行選擇旁系同源基因促成了它們多樣化形成葉球和塊莖形態。
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