不好的內切酶常常被各種蛋白酶、非特異外切酶和核酸外切酶污染。使用被外切酶污染的內切酶切割DNA，則會在切割底物的同時破壞產物的末端（外切酶偷偷切掉1、2個bp，瓊脂糖電泳卻看不出來），讓后續的連接、克隆和表達出現問題！
而NEB提供的內切酶大部分都經過重組改造，在最大程度上避免了外切酶污染的問題，讓你的基因安全可靠！
好的內切酶 | 不好的內切酶 |
· 活性高 | ·活性不高 |
成功連接，克隆并表達 | 連接失敗，克隆不成功，無法表達或產物不正確 |
質粒DNA |
| 酶切反應 |
| 好的內切酶切割 不好的內切酶切割 |
| 完整的DNA片段 連接 完整的DNA片段 少量的外切酶損壞DNA末端 不完整的DNA片段+1、2個dNTP 連接 |